Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms