Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm2035J3QP87 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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