Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms