Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp988F6VKC7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms