Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm340F6RGI3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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