Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms