Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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