Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms