Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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