Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtf1A2AQ19 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtf1A2AQ19 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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