Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms