Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubl3Q9Z2M6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms