Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms