Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms