Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms