Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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