Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl39Q9JKF7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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