Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DysfQ9ESD7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms