Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SelenofQ9ERR7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.3 ms