Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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