Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tlr1Q9EPQ1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tlr1Q9EPQ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tlr1Q9EPQ1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tlr1Q9EPQ1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms