Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms