Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAE8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAE8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms