Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms