Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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