Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsraQ9D6Y7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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MsraQ9D6Y7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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MsraQ9D6Y7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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MsraQ9D6Y7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsraQ9D6Y7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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