Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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