Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ChtopQ9CY57 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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