Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms