Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CQM1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms