Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudt21Q9CQF3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms