Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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