Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms