Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramel1Q99MW3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms