Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms