Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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