Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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