Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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