Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek9Q8K1R7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms