Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf20l1Q8CCJ9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf20l1Q8CCJ9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms