Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pm20d1Q8C165 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms