Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trerf1Q8BXJ2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trerf1Q8BXJ2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms