Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms