Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kdm4aQ8BW72 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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