Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms