Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ChfrQ810L3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChfrQ810L3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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