Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg2bQ80XK6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms