Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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