Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc155Q80VJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc155Q80VJ8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms