Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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